日治大正二年(民國二年)，奉准創立，稱為六甲公學校官佃分校。 日治大正七年(民國七年)四月一日獨立，改為官佃公學校。 日治大正九年(民國九年)四月一日，創立番子田、渡頭、社子等分離教室。 日治大正九年(民國九年)十一月一日，校名改為官田公學校。 日治大正十年(民國十年)四月一日，創立二鎮分離教室。 日治大正十一年(民國十一年)四月一日，廢止社子分離教室及二鎮分離教室。 日治大正十二年(民國十二年)四月一日，校名番子田渡頭分離教室改稱番子田渡頭分教場。 日治昭和十五年(民國二十九年)四月一日，番子田渡頭分教場校址移轉番子田，改稱番子田分教場。 民國三十五年一月一日： 校名本校改稱為官田鄉第一國民學校。 番子田分教場改稱官田鄉第二國民學校。 民國三十六年一月一日，校名改稱為官田鄉官田國民學校。 民國四十三年九月一日，創立官田國民學校二鎮分教室。 民國四十四年元月一日，創立官田國民學校渡拔分校。 民國四十五年八月三十一日，廢除官田國民學校二鎮分教室。 民國四十七年八月一日，渡拔分校獨立，改稱官田鄉渡拔國民學校。 民國五十七年八月一日，校名改稱台南縣官田鄉官田國民小學。 民國九十九年十二月二十五日，因應台南縣、市合併為台南市，校名改稱台南市官田區官田國民小學。